Pieerot PLUS的前身为“股份有限公司旗舰工作室”（株式会社スタジオ旗舰）。由动画制作人草野启二（龙之子Production的制作出身）就任代表取缔役社长，和龙之子制作公司制作出身、曾经在日升动画及Wako-Pro担任制作人的栃平吉和于1992年共同创立。

起初协助制作18禁OVA，不久后接到幼教动画《可爱巧虎岛》的委托，开始两边都做。1996年，社内的清水修建立ARMS专门接受18禁动画的委托，旗舰工作室则专注于一般向动画，除了长寿动画《可爱巧虎岛》外，还接受其它公司的外包，特别是PIERROT的外包。

2008年9月，旗舰工作室从东京都中野区上鹭宫搬移至练马区。

2009年10月1日改名“股份有限公司Pierrot PLUS”（株式会社ぴえろプラス）。在多数动画作品的场合下以“Pierrot PLUS”、“Pierrot+”表示。在商标著作上则以“Studio Pierrot+”表示。